45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1295 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
522 aa  1083    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
859 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
517 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
550 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.15 
 
 
424 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.92 
 
 
433 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
516 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
545 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  22.67 
 
 
432 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  23.69 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  20.07 
 
 
371 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.33 
 
 
432 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
507 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
447 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  21.52 
 
 
428 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  26.13 
 
 
378 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
422 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 
369 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  22.85 
 
 
405 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  22.88 
 
 
861 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  23.76 
 
 
433 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  39.66 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
376 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  21.36 
 
 
398 aa  47  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  21.38 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  19.59 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  24.46 
 
 
426 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
417 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
435 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  28.57 
 
 
420 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
358 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
358 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  31.76 
 
 
362 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>