More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4940 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
375 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  46.34 
 
 
367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
373 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
372 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  28.8 
 
 
387 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
353 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  26.98 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  25.7 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.7 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.73 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  26.92 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  23.72 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.92 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  43.04 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  26.08 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  23.86 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
463 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.73 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  33.68 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
420 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.32 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  41.67 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.81 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.63 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.17 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.25 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.07 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
407 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.61 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  34.88 
 
 
557 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.43 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
535 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
446 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  20.82 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  20.82 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  21.7 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  21.82 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  21.54 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.23 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.46 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
463 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.67 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.78 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>