170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0163 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  100 
 
 
362 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  84.68 
 
 
362 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  54.7 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  53.07 
 
 
373 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  46.51 
 
 
372 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  45.84 
 
 
387 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
392 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
399 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.68 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2023  glycosyltransferase  24.45 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.54 
 
 
372 aa  62.8  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  25.7 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.7 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
395 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 
424 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.7 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  29.48 
 
 
417 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  24.57 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
405 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
396 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
405 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.03 
 
 
413 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.03 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.03 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  27.78 
 
 
454 aa  52.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
410 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.45 
 
 
406 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  28.57 
 
 
484 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.45 
 
 
406 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
416 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  30 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  28.86 
 
 
371 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  27.81 
 
 
569 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.73 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
409 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
384 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2121  hypothetical protein  25.19 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.93 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  32.67 
 
 
557 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.82 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
376 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.83 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.55 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.55 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16521  glycosyl transferases group 1  20.78 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.524889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  20.07 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.55 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
353 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  19.94 
 
 
369 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>