15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2023 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2023  glycosyltransferase  100 
 
 
383 aa  783    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  24.73 
 
 
362 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  25.2 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  19.88 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  28.85 
 
 
754 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  21.57 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
903 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
346 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>