More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1604 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  794    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
381 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
372 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
374 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
373 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
392 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
366 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  27.22 
 
 
433 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  26.3 
 
 
432 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
432 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
385 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
369 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
381 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
463 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
415 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  26.8 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
390 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.1 
 
 
404 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
395 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  25.96 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  21.14 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  26.4 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  27.76 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  23.32 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.28 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  29.68 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.06 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0309  hypothetical protein  24.5 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000373885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  24.16 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0327  hypothetical protein  24.5 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5824  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.92 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  26.37 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  23.99 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.56 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.25 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
522 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.84 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.89 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>