83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7648 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  31.38 
 
 
484 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
430 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  22.56 
 
 
369 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  22.56 
 
 
369 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  24.57 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
415 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.84 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.84 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.96 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
859 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  23.68 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
507 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  29.2 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  25 
 
 
861 aa  63.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  27.65 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
550 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
519 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  18.64 
 
 
369 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
517 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  24.52 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
518 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.47 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  29.53 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
540 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1087  hypothetical protein  25 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0594  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730707  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.37 
 
 
564 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
468 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
391 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
463 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
353 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
390 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.47 
 
 
404 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3923  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192357  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  22.22 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.85 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  19.59 
 
 
522 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  23.91 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0362  hypothetical protein  19.08 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
447 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.15 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  28.73 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  32.76 
 
 
384 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  24.83 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
398 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0309  hypothetical protein  18.7 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000373885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0327  hypothetical protein  18.7 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
367 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>