More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2080 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 447 aa  873    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  65.22 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  65.71 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  48.09 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  46.76 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 859 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  39.82 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 518 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  42.24 
 
 		 545 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  39.58 
 
 		 861 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  34.77 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.1 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  20.13 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  19.74 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.74 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  29 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.87 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.69 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  21.92 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  20.87 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.67 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  19.81 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0792  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  28.64 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  23.47 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  29.23 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  21.88 
 
 		 378 aa  57  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 370 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  40.96 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.77 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  30.86 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.22 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.42 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 417 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  20.45 
 
 		 537 aa  53.5  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  21.43 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>