96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4643 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
518 aa  1043    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  54.13 
 
 
516 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  55.22 
 
 
545 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
550 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
540 aa  269  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  36.74 
 
 
517 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
519 aa  250  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
859 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 
447 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  36.21 
 
 
861 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
415 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  29.74 
 
 
484 aa  96.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
401 aa  94.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  20.71 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  19.81 
 
 
432 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
388 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.81 
 
 
432 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
430 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
419 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
366 aa  63.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
400 aa  63.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.45 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
403 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  21.92 
 
 
382 aa  60.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  23.8 
 
 
369 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  23.8 
 
 
369 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  20.12 
 
 
373 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
348 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
391 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  21.25 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
398 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  19.81 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.45 
 
 
838 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
481 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
403 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
392 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
371 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
382 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  23.29 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  20.88 
 
 
395 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
416 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
378 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.09 
 
 
403 aa  47.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
435 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
453 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2429  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
419 aa  47  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
390 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
393 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
362 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
836 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
822 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  19.87 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
378 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  20.62 
 
 
404 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  21.43 
 
 
430 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
396 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
376 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.44 
 
 
723 aa  44.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
373 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2676  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
569 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  22.9 
 
 
378 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
405 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
357 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.78 
 
 
394 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
393 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>