More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1689 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
540 aa  1057    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  90.19 
 
 
550 aa  943    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  62.4 
 
 
517 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  60.04 
 
 
519 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  65.32 
 
 
447 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 
516 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
507 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
518 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
859 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  40.2 
 
 
545 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  37.25 
 
 
861 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  32.52 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
401 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
415 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.71 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.3 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.71 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24.71 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.3 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
353 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
425 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  22.04 
 
 
404 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
370 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
424 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
373 aa  63.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
386 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.24 
 
 
349 aa  63.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  30.8 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
372 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
378 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
452 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
388 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
361 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  21.77 
 
 
395 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  21.82 
 
 
393 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
463 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.06 
 
 
374 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
369 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
405 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
417 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  28 
 
 
373 aa  57  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  22.17 
 
 
393 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
394 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
445 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
394 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
385 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
411 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.18 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
376 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  20.73 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
399 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  29.07 
 
 
417 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.95 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
375 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
434 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.37 
 
 
450 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.76 
 
 
340 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
411 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  21.95 
 
 
384 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
377 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
403 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
377 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
388 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.55 
 
 
377 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
475 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
458 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
393 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
376 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
481 aa  54.3  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.02 
 
 
383 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
422 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
404 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
376 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  31.18 
 
 
387 aa  53.9  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
517 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
374 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
382 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
411 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  31.73 
 
 
364 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  26.39 
 
 
447 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
390 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
379 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
419 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>