More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2522 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  100 
 
 
364 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  68.61 
 
 
359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  67.67 
 
 
372 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  64.62 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  60.71 
 
 
357 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  56.67 
 
 
397 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  54.57 
 
 
405 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  52.79 
 
 
666 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
378 aa  189  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 
386 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 
381 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
396 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  34.77 
 
 
375 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
379 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  36.39 
 
 
374 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
358 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
382 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  23.16 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  42.38 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  29.92 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.38 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  29.63 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  34.94 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
420 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.52 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  29.38 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.5 
 
 
778 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  41.91 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.94 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
414 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.04 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  33.33 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  45.95 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
440 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
767 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
409 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
351 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.14 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
800 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.04 
 
 
405 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.09 
 
 
403 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  35.09 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>