More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0250 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
374 aa  755    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
374 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
364 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
396 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
401 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
366 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
374 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
392 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
375 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
386 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
396 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
395 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
359 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
379 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  31.71 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.77 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  26.2 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.07 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.24 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  26.25 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  30 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.74 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  36.36 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  24.53 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  22.16 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
904 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.1 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
414 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>