170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0566 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
361 aa  726    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1682  hypothetical protein  33.71 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  34.99 
 
 
375 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1331  hypothetical protein  26.8 
 
 
359 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.823178  normal  0.713454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
385 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0885  a-glycosyltransferase  25.19 
 
 
384 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00174495  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
747 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
774 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  22.4 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
386 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  23.66 
 
 
458 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
823 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
759 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 
790 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  21.45 
 
 
360 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  21.88 
 
 
759 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  21.04 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1719  hypothetical protein  23.65 
 
 
414 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.570505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  24.74 
 
 
355 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  21.48 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  21.66 
 
 
769 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.09 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
398 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  21 
 
 
780 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
402 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  20.89 
 
 
761 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  20.1 
 
 
743 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  21.6 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  21.82 
 
 
392 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
368 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
354 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
356 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  24.67 
 
 
402 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
412 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
354 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
354 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
427 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  20.99 
 
 
395 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
387 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
397 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
765 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.68 
 
 
354 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
387 aa  46.2  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>