12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1682 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1682  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1331  hypothetical protein  32.57 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.823178  normal  0.713454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1719  hypothetical protein  22.97 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.570505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0885  a-glycosyltransferase  23.65 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00174495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  20.68 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>