More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5602 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 399 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 756 aa  299  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 790 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 765 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  34.92 
 
 		 797 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  33.78 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 823 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 761 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 759 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 763 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 747 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 789 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 774 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 780 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  33.87 
 
 		 759 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 774 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 762 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 		 767 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 416 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.69 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.75 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  20.72 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.05 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  21.74 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  25.3 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  23.19 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 770 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  23.95 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  24.11 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  22.84 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.42 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.05 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  21.25 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.02 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  21.37 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>