More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1916 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  100 
 
 
390 aa  804    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  46.7 
 
 
391 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  46.99 
 
 
391 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  44.56 
 
 
411 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  38.77 
 
 
797 aa  299  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
747 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
774 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
763 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
759 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 
780 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
790 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
765 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 
823 aa  273  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
789 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  35.48 
 
 
759 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
395 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 
761 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
762 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
774 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
399 aa  242  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
416 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
756 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
392 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
399 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
767 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
388 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
393 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
378 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
414 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
405 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
393 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.38 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  24.69 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  25.4 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.56 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  22.05 
 
 
414 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.35 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  24.24 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.06 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
380 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  21.38 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.38 
 
 
408 aa  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
378 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  21.41 
 
 
375 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.28 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4279  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  20.69 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  21.18 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  20.81 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
448 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.11 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  21.86 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.28 
 
 
838 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.47 
 
 
382 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
1233 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
366 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  21.27 
 
 
417 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
382 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>