More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0740 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  50.34 
 
 
767 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
823 aa  1679    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  43.69 
 
 
774 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  42 
 
 
759 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  44.84 
 
 
761 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  41.6 
 
 
789 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
790 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 
780 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 
763 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  41.52 
 
 
765 aa  519  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
747 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
759 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  31.93 
 
 
797 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
774 aa  364  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
756 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
762 aa  343  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 
411 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
391 aa  293  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
391 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 
386 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  37.13 
 
 
390 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  40.16 
 
 
405 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
395 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
397 aa  240  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 
416 aa  238  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
399 aa  234  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
399 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
371 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
393 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
388 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
414 aa  190  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
393 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
393 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  33.43 
 
 
353 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
393 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  33.13 
 
 
337 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
392 aa  180  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
378 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  31.25 
 
 
349 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
405 aa  174  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  32.09 
 
 
364 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  34 
 
 
404 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  28.57 
 
 
360 aa  147  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  35.94 
 
 
338 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  37.65 
 
 
351 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  31.53 
 
 
378 aa  144  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  34.55 
 
 
367 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  33.43 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  31.29 
 
 
348 aa  121  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  28.61 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  33.74 
 
 
340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  31.1 
 
 
340 aa  100  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
388 aa  79.7  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
1233 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
378 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
366 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
397 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.24 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.69 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
374 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
386 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 
374 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
385 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
748 aa  65.1  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
371 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
384 aa  64.7  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
396 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
536 aa  64.3  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
1267 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.33 
 
 
383 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
401 aa  64.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
374 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
386 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  25.13 
 
 
395 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
405 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
408 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  18.15 
 
 
1232 aa  60.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  24.23 
 
 
1635 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
390 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  20.56 
 
 
388 aa  60.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
366 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
364 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
409 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
405 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
495 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
358 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.19 
 
 
395 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
475 aa  59.3  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
364 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
499 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
498 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
378 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
378 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
443 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>