36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0361 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  768    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  65.08 
 
 
371 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  45.7 
 
 
404 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  36.13 
 
 
349 aa  242  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  35.33 
 
 
360 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  35.16 
 
 
337 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
747 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
774 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  35.04 
 
 
353 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
759 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
763 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  32.37 
 
 
797 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  33.14 
 
 
364 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
790 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
780 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
765 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  32.66 
 
 
759 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  31.22 
 
 
339 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
789 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
761 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
823 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
767 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  32.4 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
756 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  32.19 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  32.09 
 
 
340 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  32.12 
 
 
340 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  31.67 
 
 
351 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  29.48 
 
 
348 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
774 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
762 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  22.22 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  24.74 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  48.89 
 
 
703 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  26.45 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>