16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42049 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  100 
 
 		 422 aa  859    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  50.92 
 
 		 275 aa  256  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  29.91 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  27.98 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  31.91 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  29.19 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  27.42 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  26.85 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  30.11 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  27.81 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  26.6 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  28.04 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  28.49 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  27.04 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  26.45 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>