23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5519 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 380 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  31.59 
 
 		 535 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  30.7 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  27.91 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  28.94 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  30.99 
 
 		 613 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  32.39 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  33.54 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  27.91 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  33.97 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  27.31 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  27.78 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  22.59 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  25.58 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  26.13 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  26.6 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  25.09 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.29 
 
 		 499 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.29 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  28.57 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  26.67 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  25.31 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>