30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3987 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 410 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  33.25 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  27.22 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  32.43 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  28.7 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  32.32 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  30.42 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  31.01 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  32.16 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  29.17 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  26.62 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  25 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  38.46 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  22.59 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  32.43 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.94 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  29.6 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  28.99 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  30.2 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  28.5 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  26.13 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  23.87 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.41 
 
 		 499 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  30.23 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>