47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2725 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 535 aa  1103    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  37.03 
 
 		 514 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  32.09 
 
 		 383 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  31.59 
 
 		 380 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  29.53 
 
 		 613 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  29.84 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  27.27 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  26.13 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  23.94 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  25.85 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  26.7 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  30.25 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  26.24 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  27.12 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  25.68 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  29.52 
 
 		 1139 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  26.94 
 
 		 371 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 370 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.97 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.25 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.06 
 
 		 884 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.78 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  27.66 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  32.26 
 
 		 957 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  37.21 
 
 		 491 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  29.2 
 
 		 401 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  41.11 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.03 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  26.13 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  40.54 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.07 
 
 		 2073 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  26.44 
 
 		 571 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  21.95 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.6 
 
 		 648 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  27.61 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  29.29 
 
 		 615 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  23.53 
 
 		 275 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  28.36 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  29.59 
 
 		 1141 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  35 
 
 		 644 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  25.78 
 
 		 1259 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.37 
 
 		 507 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  25.28 
 
 		 400 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  30.97 
 
 		 373 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  24.03 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>