23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0608 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 400 aa  803    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  64.37 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  37.32 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  36.8 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  36.41 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  36.6 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  34.94 
 
 		 376 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  31.66 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  31.47 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  27.41 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  24.9 
 
 		 614 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  25.19 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  29.41 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  26.43 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  28.77 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  26.26 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  24.28 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  25.28 
 
 		 535 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  23.38 
 
 		 492 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>