25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0666 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
370 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  82.49 
 
 
377 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  77.48 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  77.48 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  77.48 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  74.24 
 
 
376 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  52.92 
 
 
373 aa  332  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  52.01 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  47.75 
 
 
371 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  38.11 
 
 
405 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  35.48 
 
 
400 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  34.98 
 
 
380 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  30.25 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  26.32 
 
 
613 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  27.78 
 
 
492 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  27.1 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  27.64 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  24.19 
 
 
535 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  26.52 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  29.08 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  29.41 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  27.07 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.36 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  24.59 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>