30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2402 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 
387 aa  797    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  38.53 
 
 
425 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  29.69 
 
 
358 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  29.68 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  30.54 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  28.26 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  31.13 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  33.33 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  35.4 
 
 
614 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  23.91 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  26.64 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  26.03 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.45 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  26.39 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  30.25 
 
 
535 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.95 
 
 
462 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  28.57 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  28.89 
 
 
499 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  28.38 
 
 
514 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  32.43 
 
 
410 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  26.47 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  26.88 
 
 
275 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  27.42 
 
 
422 aa  53.9  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
370 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  25.19 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  25.71 
 
 
405 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08421  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  26.11 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.259019  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 
377 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  26.56 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  25 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0779886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>