35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0389 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 363 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  49.23 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.57 
 
 		 479 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  42.22 
 
 		 492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  42.9 
 
 		 614 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  36.54 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.1 
 
 		 462 aa  86.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  32.39 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04504  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  33 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289237  normal  0.827131 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  30.54 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  26.04 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  27.27 
 
 		 535 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  25.79 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0779886 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.24 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  30.82 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  25.14 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  26.87 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  29.09 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  25.61 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.33 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  24.81 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  29.6 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  29.19 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08421  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  23.42 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.259019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  28.4 
 
 		 514 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  28.77 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  29.55 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  29.61 
 
 		 275 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  28.66 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>