26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0239 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
377 aa  760    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  82.49 
 
 
370 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  76.66 
 
 
387 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  76.66 
 
 
387 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  76.66 
 
 
387 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  71.98 
 
 
376 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  52.73 
 
 
373 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  51.65 
 
 
356 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  47.48 
 
 
371 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  37.38 
 
 
405 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  34.18 
 
 
400 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  37.45 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  30.37 
 
 
410 aa  86.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  27.64 
 
 
613 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  27.27 
 
 
492 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  25.38 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  27.11 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  27.54 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  27.96 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  27.17 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  21.4 
 
 
535 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  26.34 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  25.87 
 
 
275 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  24.59 
 
 
380 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.24 
 
 
385 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  28.74 
 
 
614 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>