27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5225 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 614 aa  1231    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  44.34 
 
 		 492 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  43.22 
 
 		 386 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  42.42 
 
 		 363 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  43.09 
 
 		 479 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  35.31 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  25.09 
 
 		 457 aa  87  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  25.64 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  29.82 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  31.87 
 
 		 613 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.64 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  27.91 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  28 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  25.85 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  30.4 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.59 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04504  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.53 
 
 		 632 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289237  normal  0.827131 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08421  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  26.47 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.259019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  23.61 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  23.33 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  25.08 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  23.28 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  28.44 
 
 		 383 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  24.9 
 
 		 400 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  27.27 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  30.11 
 
 		 422 aa  50.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>