63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6876 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 514 aa  1055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  37.03 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  26.11 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  27.91 
 
 		 380 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  24.27 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  26.77 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  28.57 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  23.28 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  28.38 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  31.47 
 
 		 1148 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.16 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  35.16 
 
 		 1049 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  38.1 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  29.45 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  31.47 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.09 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.76 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.74 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  30.5 
 
 		 726 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  25 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  32 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  32.12 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.2 
 
 		 737 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.58 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.43 
 
 		 963 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  28.4 
 
 		 363 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  31.88 
 
 		 771 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  29.22 
 
 		 571 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  25.43 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.62 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  31.47 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  36.49 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.71 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.99 
 
 		 672 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.14 
 
 		 494 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  30.49 
 
 		 563 aa  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.54 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.89 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  30.28 
 
 		 656 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.71 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 1187 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6313  hypothetical protein  29.01 
 
 		 170 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  24.41 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.29 
 
 		 520 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.53 
 
 		 756 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  26.9 
 
 		 806 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.81 
 
 		 691 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 497 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  27.95 
 
 		 172 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  28.48 
 
 		 664 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.92 
 
 		 789 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.33 
 
 		 648 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>