24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5961 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 383 aa  793    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  32.38 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  30.7 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  26.02 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  29.9 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  33.33 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  25.61 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  23.19 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  28.44 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  25.79 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  29.41 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  24.17 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  30.2 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  24.68 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  25 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  26.26 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  26.26 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  25.35 
 
 		 275 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>