17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0505 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  100 
 
 		 373 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  53.43 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  52.67 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  53.05 
 
 		 387 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  53.05 
 
 		 387 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  53.05 
 
 		 387 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  52.32 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  48.46 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  44.53 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  35.64 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  35.51 
 
 		 405 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  36.1 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  29.91 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  27.51 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  23.37 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  25.63 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  24.9 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>