32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1592 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 380 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  46.22 
 
 		 613 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  28.57 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  37.45 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  32.27 
 
 		 371 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  29.43 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  28.94 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  33.22 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  29.36 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  31.45 
 
 		 356 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  37.28 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  30.03 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  29.9 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  26.99 
 
 		 535 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  28.96 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  29.82 
 
 		 614 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  28.9 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  27.34 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  27.78 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  26.64 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  24.56 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  27.54 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.9 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  28.98 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  27.32 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  28.67 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  25.51 
 
 		 457 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0779886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>