29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6932 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 371 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  47.53 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  47.92 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  49.72 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  45.97 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  45.97 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  45.97 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  44.15 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  45.53 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  37.28 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  39.53 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  33.25 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  28.45 
 
 		 613 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  35.32 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  26.94 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  25.46 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  23.44 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  29.28 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  26.19 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  26.44 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.1 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  23.05 
 
 		 492 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  23.88 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  27.03 
 
 		 614 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  28.04 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  23.24 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  25.37 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.34 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>