25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3279 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 356 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  52.01 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  51.65 
 
 		 377 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  51.88 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  51.88 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  51.88 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  51.41 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  47.84 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  50 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  38.8 
 
 		 405 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  36.6 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  30.95 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  29.56 
 
 		 613 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  30.82 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  25.46 
 
 		 535 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  26.25 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  25.71 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  24.83 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 425 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  28.72 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  26.21 
 
 		 479 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  22.07 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  28.95 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  22.83 
 
 		 614 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.44 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>