23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10370 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  74.86 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  74.86 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  73.74 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  74.86 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  70.6 
 
 		 377 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  52.47 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  51.69 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  46.36 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  38.15 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  35.62 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  33.47 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  30.82 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  25.68 
 
 		 613 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  23.74 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  25.27 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  26.26 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  22.28 
 
 		 535 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  25.35 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  28.66 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  26.78 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  27.54 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 425 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>