18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59845 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  50.74 
 
 		 422 aa  266  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  33.17 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  29.56 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  27.18 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  30.57 
 
 		 479 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  33.97 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  26.37 
 
 		 380 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  29.19 
 
 		 363 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  25.52 
 
 		 456 aa  48.9  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  26.9 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  23.53 
 
 		 535 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  23.53 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 370 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  25 
 
 		 613 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>