23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2597 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 358 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  29.69 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  35.91 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  33.54 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  30.62 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  26.13 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  30.07 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  29.56 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  26.77 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  30.82 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  29.82 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  23.61 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  29.41 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  23.73 
 
 		 492 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  22.61 
 
 		 479 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  25.26 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  24.03 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  24.28 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  23.87 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.1 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>