113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1461 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  64.12 
 
 		 563 aa  673    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  100 
 
 		 560 aa  1129    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1869  parallel beta-helix repeat protein  60.29 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08927  conserved hypothetical protein  45.51 
 
 		 355 aa  259  9e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096319 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3897  Parallel beta-helix repeat protein  38.23 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00247458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.44 
 
 		 582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.12 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3900  hypothetical protein  35.19 
 
 		 731 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.020807  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  31.07 
 
 		 744 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.32 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  45.03 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.02 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  43.35 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  47.5 
 
 		 691 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.65 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  37.11 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  47.89 
 
 		 401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.73 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  39.13 
 
 		 1139 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  41.98 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  39.16 
 
 		 789 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  39.42 
 
 		 571 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.19 
 
 		 491 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.42 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  37.86 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.96 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  37.76 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.77 
 
 		 507 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  37.96 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.5 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  34.68 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  35.42 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.81 
 
 		 957 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  34.38 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  34.81 
 
 		 884 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.94 
 
 		 2073 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.91 
 
 		 794 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  38.97 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.78 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 		 618 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 737 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.46 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.37 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  38.81 
 
 		 771 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  30.94 
 
 		 897 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.07 
 
 		 503 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.62 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  39.78 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  36.76 
 
 		 1187 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.65 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.95 
 
 		 943 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  34.39 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.86 
 
 		 1413 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.94 
 
 		 1567 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.59 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  32.17 
 
 		 1259 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.62 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.7 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  32.37 
 
 		 963 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.3 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.55 
 
 		 663 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  33.88 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  31.72 
 
 		 1141 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  28.93 
 
 		 1222 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  31.78 
 
 		 1100 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  32.33 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 		 709 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  29.49 
 
 		 482 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.06 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.06 
 
 		 806 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.06 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.06 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.06 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 806 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 522 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 1148 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 239 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.82 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  37.9 
 
 		 748 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  41.77 
 
 		 1016 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30 
 
 		 803 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  28.36 
 
 		 576 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  33.01 
 
 		 1347 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  27.18 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  30.94 
 
 		 664 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  27.06 
 
 		 1172 aa  50.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 1049 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 		 756 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.91 
 
 		 806 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  32.88 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1817  Ricin B lectin  30.51 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  33.06 
 
 		 726 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 489 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 1072 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 		 933 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>