73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3068 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  100 
 
 		 489 aa  1015    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 1139 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  30.72 
 
 		 1187 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.12 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.62 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  28.87 
 
 		 691 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.47 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.1 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  30.15 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.69 
 
 		 1259 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.76 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.56 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  26.24 
 
 		 535 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.58 
 
 		 884 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  26.28 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.28 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25.71 
 
 		 1413 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  29.25 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.46 
 
 		 957 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  29.63 
 
 		 392 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.86 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.68 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.72 
 
 		 2073 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  30.08 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  30.28 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  29.41 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1817  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.07 
 
 		 615 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  39.66 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  31 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 494 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.78 
 
 		 982 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  26.02 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  26.89 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  27.27 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  31 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  23.24 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.68 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.3 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  25.97 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  33.72 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.86 
 
 		 863 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.4 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.4 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  27.71 
 
 		 789 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.4 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  26.17 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  33.94 
 
 		 452 aa  47.8  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.67 
 
 		 756 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.21 
 
 		 943 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  28 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  25.71 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.02 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  35.53 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  28 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  30.65 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  26.5 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  33.66 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  30.83 
 
 		 582 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 1025 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  26.17 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  28.3 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  32.08 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  27 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  27 
 
 		 470 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  28.3 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  29.91 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>