More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2667 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  67.17 
 
 
460 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  66.96 
 
 
460 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  66.3 
 
 
465 aa  660    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  66.52 
 
 
460 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  71.09 
 
 
464 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  66.74 
 
 
470 aa  667    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  100 
 
 
470 aa  975    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  66.52 
 
 
460 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  67.17 
 
 
460 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  67.17 
 
 
462 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  65.22 
 
 
461 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  58.04 
 
 
460 aa  568  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  58.91 
 
 
461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  56.74 
 
 
459 aa  558  1e-158  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  58.66 
 
 
461 aa  552  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  55.77 
 
 
470 aa  552  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  56.86 
 
 
457 aa  541  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  54.76 
 
 
459 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  54.76 
 
 
459 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  52.71 
 
 
469 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  51.2 
 
 
475 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.59 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  43.45 
 
 
478 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  43.64 
 
 
478 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  42.32 
 
 
478 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  42.52 
 
 
465 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  43.83 
 
 
475 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  43.86 
 
 
452 aa  363  3e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  42.18 
 
 
465 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  41.01 
 
 
451 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.56 
 
 
471 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  38.77 
 
 
467 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  39.13 
 
 
453 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  40.65 
 
 
446 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.96 
 
 
446 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  40.04 
 
 
469 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  40.22 
 
 
446 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  40.44 
 
 
444 aa  325  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  38.07 
 
 
446 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  37.77 
 
 
452 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  37.17 
 
 
474 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  40.3 
 
 
468 aa  322  6e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  40.13 
 
 
478 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  38.27 
 
 
463 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  39.18 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  40.71 
 
 
438 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.41 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  38.54 
 
 
474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  36.9 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  38.22 
 
 
478 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  35.25 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  37.58 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  38.17 
 
 
458 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  39.06 
 
 
443 aa  306  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  37.53 
 
 
450 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  36.46 
 
 
467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  37.87 
 
 
909 aa  302  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  38.25 
 
 
478 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  36.23 
 
 
479 aa  302  9e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  38.48 
 
 
469 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  37.66 
 
 
478 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  37.02 
 
 
476 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  36.97 
 
 
484 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  37.32 
 
 
478 aa  296  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  37.55 
 
 
470 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  34.98 
 
 
452 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  36.52 
 
 
439 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  36.6 
 
 
470 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  36.29 
 
 
467 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  35.91 
 
 
467 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  37.86 
 
 
453 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  35.65 
 
 
482 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  34.6 
 
 
475 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  37.85 
 
 
488 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  36.29 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  37.92 
 
 
455 aa  286  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  37.03 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  37.1 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  36.38 
 
 
494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  36.12 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  36.9 
 
 
474 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  36.12 
 
 
457 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  36.78 
 
 
447 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  35.68 
 
 
448 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  34.85 
 
 
499 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  36.22 
 
 
439 aa  280  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  36.89 
 
 
436 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  35.82 
 
 
517 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  36.48 
 
 
456 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  36.88 
 
 
448 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  37.34 
 
 
475 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  35.18 
 
 
485 aa  278  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  37.34 
 
 
475 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  36.48 
 
 
471 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.77 
 
 
458 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  35.04 
 
 
472 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  36.19 
 
 
448 aa  276  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  36.09 
 
 
455 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  37.26 
 
 
482 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  35.4 
 
 
466 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>