More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2958 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  100 
 
 		 463 aa  938    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  61.81 
 
 		 439 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  50.23 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  49.79 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  50.76 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  46.53 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  54.05 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  49.44 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  51.56 
 
 		 482 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  50.9 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  50.68 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  50.34 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  51.17 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  46.29 
 
 		 446 aa  421  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  49.56 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  50.53 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  51.54 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  50.34 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  49.36 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  51.03 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  51.31 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  53.55 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  48.81 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  47.79 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  47.93 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  50.66 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  46 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  44.07 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  50.54 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  50.53 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  49.89 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  47.5 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.85 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  50.11 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  47.7 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  50.11 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  46.56 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  45.31 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  49.32 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  48.42 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  46.22 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  46.88 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  48.97 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  49.89 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  45.29 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  47.74 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  43.05 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  45.1 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  47.72 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  45.56 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  47.18 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  45.6 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  47.42 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  45.37 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  47.55 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  46.35 
 
 		 500 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  40.79 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  46.06 
 
 		 482 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  44.02 
 
 		 447 aa  362  6e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  45.02 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  44.62 
 
 		 465 aa  359  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  45.9 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  45.53 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  46.83 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  45.02 
 
 		 457 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  48.48 
 
 		 472 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  45.37 
 
 		 440 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  43.28 
 
 		 491 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  46.15 
 
 		 455 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  45.37 
 
 		 440 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  45.13 
 
 		 494 aa  349  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  45.89 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  47.56 
 
 		 463 aa  345  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  44.66 
 
 		 488 aa  345  8e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  44.4 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  45.37 
 
 		 448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  44.06 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  41.72 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  43.53 
 
 		 482 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  40.22 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  42.6 
 
 		 470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  43.88 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  42.79 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  43.09 
 
 		 444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  42.5 
 
 		 468 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  43.99 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  43.54 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  44.44 
 
 		 479 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  44 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  40.99 
 
 		 443 aa  329  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  43.15 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  40.39 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  39.82 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  39.82 
 
 		 451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  41.91 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  37.88 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  40.05 
 
 		 451 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  40.32 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  40.05 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  44.55 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>