More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0202 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  100 
 
 
459 aa  947    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  61.22 
 
 
457 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  58.08 
 
 
464 aa  568  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  56.74 
 
 
470 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  54.05 
 
 
460 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  54.05 
 
 
460 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  53.83 
 
 
460 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  55.58 
 
 
462 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  53.83 
 
 
460 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  53.83 
 
 
460 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  54.59 
 
 
461 aa  547  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  53.17 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  53.61 
 
 
465 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  56.99 
 
 
459 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  56.33 
 
 
459 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  54.39 
 
 
461 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  56.43 
 
 
461 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  53.17 
 
 
460 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  52.93 
 
 
470 aa  502  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  50.65 
 
 
469 aa  480  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  50.43 
 
 
475 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  49.14 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  43.82 
 
 
478 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  44.01 
 
 
478 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  43.07 
 
 
452 aa  382  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  44.01 
 
 
478 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 
475 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  38.33 
 
 
465 aa  334  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  35.26 
 
 
467 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  35.29 
 
 
450 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  37.5 
 
 
469 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  34.93 
 
 
471 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  34.55 
 
 
465 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  36.7 
 
 
451 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  36.68 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  36.24 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  36.79 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.84 
 
 
446 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  33.7 
 
 
458 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  36.23 
 
 
469 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  32.75 
 
 
474 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.52 
 
 
463 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.19 
 
 
453 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  31.43 
 
 
439 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  34.04 
 
 
452 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  35.37 
 
 
446 aa  264  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  32.43 
 
 
478 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  32.92 
 
 
475 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  33.19 
 
 
444 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  32.75 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  32.26 
 
 
476 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.85 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  34.67 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  33.19 
 
 
478 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  34.42 
 
 
438 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.37 
 
 
479 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  30.57 
 
 
488 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.13 
 
 
478 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  33.4 
 
 
470 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  32.44 
 
 
478 aa  247  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  30.17 
 
 
478 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.69 
 
 
472 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  31.91 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  33.12 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  31.63 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  31.89 
 
 
909 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  30.04 
 
 
474 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  32.98 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  32.98 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  29.5 
 
 
491 aa  242  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  32.75 
 
 
451 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  31.05 
 
 
478 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  32.77 
 
 
468 aa  240  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  30.9 
 
 
474 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  31.17 
 
 
482 aa  239  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  29.8 
 
 
458 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.33 
 
 
439 aa  237  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  32.84 
 
 
470 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  30.15 
 
 
466 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  31.41 
 
 
461 aa  236  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  31.37 
 
 
448 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  28.95 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  32.55 
 
 
461 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  33.48 
 
 
475 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  30.62 
 
 
443 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  29.24 
 
 
472 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  29.57 
 
 
455 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  33.26 
 
 
469 aa  231  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  29.36 
 
 
456 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  30.4 
 
 
457 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  29.1 
 
 
448 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  33.62 
 
 
475 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  28.12 
 
 
487 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  30.18 
 
 
457 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  29.65 
 
 
452 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  31.33 
 
 
466 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  31.45 
 
 
474 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  32.42 
 
 
464 aa  225  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  29.25 
 
 
471 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  28.67 
 
 
482 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>