More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0288 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  100 
 
 
444 aa  909    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  63.84 
 
 
458 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  56.98 
 
 
456 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  60.49 
 
 
448 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  60.94 
 
 
453 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  55.96 
 
 
452 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  51.79 
 
 
451 aa  484  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  55.68 
 
 
453 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  51.94 
 
 
438 aa  480  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  55.43 
 
 
472 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  55.11 
 
 
478 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  58.86 
 
 
443 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  53.54 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  52.33 
 
 
474 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  51.82 
 
 
474 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  51.14 
 
 
446 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  51.14 
 
 
446 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  54.42 
 
 
478 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  53.66 
 
 
467 aa  458  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  49.89 
 
 
471 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  51.97 
 
 
484 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  51.21 
 
 
476 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  48.87 
 
 
446 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  51.97 
 
 
487 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  50.57 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  55.19 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  51.76 
 
 
467 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  54.95 
 
 
459 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  51.77 
 
 
462 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  53.83 
 
 
488 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  52.17 
 
 
448 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  55.46 
 
 
457 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  49.89 
 
 
447 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  50 
 
 
454 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  49.23 
 
 
472 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  52.51 
 
 
470 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  52.09 
 
 
474 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  48.98 
 
 
446 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  51.83 
 
 
440 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  52.02 
 
 
500 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  52.85 
 
 
471 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  51.05 
 
 
470 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  52.2 
 
 
489 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  48.28 
 
 
447 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  50.87 
 
 
470 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  50.99 
 
 
463 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  50.11 
 
 
439 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  50.34 
 
 
463 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  52.85 
 
 
466 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  53.35 
 
 
436 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  51.31 
 
 
482 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  48.49 
 
 
451 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  49.67 
 
 
485 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  52.55 
 
 
463 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  49.47 
 
 
467 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  51.34 
 
 
458 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  48.49 
 
 
451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  51.57 
 
 
447 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  48.81 
 
 
494 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  48.26 
 
 
451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  46.04 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  50.35 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  54.34 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  48.03 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  49.89 
 
 
455 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  50.42 
 
 
466 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  46.05 
 
 
443 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  46.76 
 
 
443 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  47.67 
 
 
443 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  47.85 
 
 
491 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  48.37 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  54.02 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  48.68 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  44.8 
 
 
450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  47.79 
 
 
444 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  49.66 
 
 
448 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  50.22 
 
 
453 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  51.11 
 
 
468 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  49.77 
 
 
452 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  47.37 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  47.34 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  47.02 
 
 
453 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  51.52 
 
 
494 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  46.47 
 
 
457 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  48.77 
 
 
456 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  48.41 
 
 
517 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  47.18 
 
 
465 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  50 
 
 
460 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  48.27 
 
 
488 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  50.82 
 
 
437 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  43.3 
 
 
461 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  47.74 
 
 
445 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  46.92 
 
 
457 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  43.34 
 
 
451 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  49.56 
 
 
455 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  46.24 
 
 
468 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  47.99 
 
 
486 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  48.11 
 
 
456 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  45.27 
 
 
467 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  41.8 
 
 
445 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>