More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1473 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  100 
 
 		 475 aa  987    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  65.61 
 
 		 479 aa  689    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  58.35 
 
 		 459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  57.7 
 
 		 459 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  51.2 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  47.97 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  50.87 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  47.96 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  50.98 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  47.01 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  50.43 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  48.28 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  47.48 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  47.63 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  46.64 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  46.85 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  46.64 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  46.42 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  45.27 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  46.42 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  45.83 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  43.82 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  42.34 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  41.09 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  41.14 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  42.46 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  39.52 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  37.29 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.12 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  34.57 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  35.04 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.2 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  35.55 
 
 		 465 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  33.62 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  36.95 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  33.99 
 
 		 467 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  34.94 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  33.62 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  34.63 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  32.62 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  32.35 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  32.7 
 
 		 476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.9 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  31.49 
 
 		 439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  32.6 
 
 		 467 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  31.13 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  33.9 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  33.9 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  31.83 
 
 		 444 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  33.19 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  33.89 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  32.28 
 
 		 478 aa  233  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  31.15 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  31.56 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  33.19 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.26 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  30.98 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.75 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  30.95 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.47 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  32.07 
 
 		 484 aa  223  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  32.75 
 
 		 470 aa  223  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  30.92 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  31.49 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  30.08 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  29.14 
 
 		 467 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.17 
 
 		 472 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  32.01 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  29.57 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  30 
 
 		 470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  30.91 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  31.97 
 
 		 909 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  28.07 
 
 		 487 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  30.32 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  30.19 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.82 
 
 		 484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  30.92 
 
 		 482 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  30.67 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  30.26 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  29.87 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  31.17 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  30.63 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  29.96 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  29.74 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  30.53 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  28.99 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  29.93 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  29.89 
 
 		 461 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  29.57 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  29.74 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  32.24 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  31.21 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  29.39 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  29.74 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  30.32 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  28.78 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>