More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3961 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  100 
 
 
487 aa  977    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  59.53 
 
 
485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  59.79 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  60.38 
 
 
479 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  58.35 
 
 
478 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  63.2 
 
 
471 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  59.05 
 
 
491 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  58.84 
 
 
459 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  58.35 
 
 
482 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  59.01 
 
 
470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  54.77 
 
 
474 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  56.44 
 
 
478 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  53.68 
 
 
476 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  56.99 
 
 
478 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  54.73 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  56.26 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  56.37 
 
 
488 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  56.17 
 
 
474 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  52.54 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  53.12 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  53.08 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  51.9 
 
 
458 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  51.97 
 
 
444 aa  457  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  54.84 
 
 
466 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  53.58 
 
 
463 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  54.68 
 
 
457 aa  448  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  52.21 
 
 
500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  52.8 
 
 
482 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  49.89 
 
 
462 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  52.73 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  53.29 
 
 
443 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  52.88 
 
 
494 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  52.2 
 
 
489 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  49.8 
 
 
517 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  49.9 
 
 
494 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  53.33 
 
 
448 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  47.87 
 
 
452 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  48.83 
 
 
453 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  46.23 
 
 
474 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  43.32 
 
 
446 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  44.59 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  54.6 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  50.63 
 
 
458 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  51.75 
 
 
472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  50.54 
 
 
468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  51.73 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  48.25 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  42.98 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.99 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.99 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  43.8 
 
 
446 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  46.04 
 
 
448 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  43.28 
 
 
452 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  45.73 
 
 
449 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  49.79 
 
 
455 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  45.45 
 
 
456 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  47.64 
 
 
439 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  45.53 
 
 
470 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  46.67 
 
 
463 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  44.42 
 
 
457 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  44.13 
 
 
438 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  49.03 
 
 
447 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  46.55 
 
 
465 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  45.31 
 
 
463 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  46.53 
 
 
440 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  41.83 
 
 
447 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  47.75 
 
 
453 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  44.78 
 
 
457 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  48.15 
 
 
436 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  41.61 
 
 
447 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  46.96 
 
 
460 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  42.16 
 
 
444 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  40.82 
 
 
443 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  41.7 
 
 
439 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  47.94 
 
 
455 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  43.66 
 
 
453 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  44.25 
 
 
457 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  41.36 
 
 
451 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  40.98 
 
 
443 aa  363  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  40.6 
 
 
451 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  40.92 
 
 
451 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  43.86 
 
 
499 aa  359  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  44.27 
 
 
452 aa  359  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  44.37 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  48.48 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  47.41 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  40.95 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  43.04 
 
 
467 aa  355  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  40.6 
 
 
454 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  44.37 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  37.88 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  44.09 
 
 
456 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  41.68 
 
 
452 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  42.71 
 
 
482 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  43.51 
 
 
450 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  38.82 
 
 
443 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  39.61 
 
 
446 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  43.36 
 
 
458 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  48.03 
 
 
444 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  43.36 
 
 
486 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>