More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4221 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  100 
 
 		 467 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  49.57 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  48.09 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  50.11 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  49.04 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  47.11 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.73 
 
 		 478 aa  458  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  45.1 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  44.37 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  43.87 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  41.47 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  40.65 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  43.46 
 
 		 470 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  40.98 
 
 		 452 aa  359  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  43.01 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  41.76 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.95 
 
 		 446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  42.52 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  42.01 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  39.41 
 
 		 468 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  42.34 
 
 		 470 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  40.94 
 
 		 452 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  40.51 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  40.48 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  41.2 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  39.91 
 
 		 478 aa  345  8e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  38.77 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  43.28 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  40.39 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  39.57 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  40.82 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  41.74 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  41.19 
 
 		 461 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  40.39 
 
 		 467 aa  335  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  36.69 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  37.39 
 
 		 461 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  40.38 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  40 
 
 		 909 aa  332  8e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  41.21 
 
 		 459 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  39.96 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  39.14 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  38.76 
 
 		 474 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  41.65 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  40.04 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  38.63 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  40.43 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  40.38 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  37.53 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  39.09 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  40.67 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  43.11 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  40.43 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  39.32 
 
 		 455 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  40.59 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  39.18 
 
 		 448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  38.43 
 
 		 466 aa  319  5e-86  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  38.18 
 
 		 485 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  41.13 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  37.53 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  39.39 
 
 		 488 aa  319  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  41.43 
 
 		 465 aa  318  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  36.99 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  38.23 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  38.31 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  42.24 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  36.99 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  39.36 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  36.99 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  38.34 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  39.74 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  39.52 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  39.53 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  36.77 
 
 		 460 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  36.77 
 
 		 460 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  38.46 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  39.44 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  35.26 
 
 		 459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  36.08 
 
 		 491 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  37.69 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  36.54 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  40.47 
 
 		 447 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  40.65 
 
 		 457 aa  313  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  38.23 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  38.92 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  41.67 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  37.92 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  39.61 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  39.7 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  37.33 
 
 		 470 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  37.7 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  39.1 
 
 		 484 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  35.92 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  38.34 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  35.56 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  41.79 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  37.93 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  37.04 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  39.45 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  38.83 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>