More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3468 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  84.1 
 
 		 478 aa  858    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 478 aa  998    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  85.36 
 
 		 478 aa  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  77.2 
 
 		 475 aa  775    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  43.98 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  43.98 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  43.82 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  42.34 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  41.61 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  41.19 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  42.32 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  40.78 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  41.39 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  41.04 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  41.5 
 
 		 460 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  41.28 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  41.06 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  41.06 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  41.28 
 
 		 460 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  40.79 
 
 		 470 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  40.75 
 
 		 462 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  40.4 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  40.84 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  40.31 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  39.47 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  38.85 
 
 		 470 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  36.93 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  34.7 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  30.61 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  32.04 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  32.97 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  33.47 
 
 		 469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.89 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.32 
 
 		 474 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  31.58 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  30.56 
 
 		 471 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  33.19 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  31.14 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  30.09 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  30.88 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  29.04 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  29.98 
 
 		 446 aa  207  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  31.62 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  32.9 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  28.02 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  30.48 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  31.13 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.57 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  31.13 
 
 		 455 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  31.61 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.45 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  31.6 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  31.04 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  31.08 
 
 		 470 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.39 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  31.08 
 
 		 470 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  30.99 
 
 		 465 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  31.53 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  29.72 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  31.74 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  31.95 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  30.74 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  30.8 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  30.24 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  29.06 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  29.27 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 467 aa  189  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  28.63 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.02 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.8 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.77 
 
 		 477 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.77 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.77 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.77 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  29.76 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.77 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.98 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  29.32 
 
 		 491 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  27.53 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.22 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  30.37 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.98 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  29.26 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  29.09 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  27.47 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  27.94 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  31.39 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.83 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  31 
 
 		 463 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.98 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  31.26 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  29.77 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  27.31 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  30.04 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.17 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  30.59 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  30.54 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>