More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2440 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  100 
 
 
491 aa  975    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  68.84 
 
 
479 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  65.31 
 
 
485 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  64.05 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  59.05 
 
 
487 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  60.99 
 
 
482 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  62.39 
 
 
471 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  57.32 
 
 
470 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  52.62 
 
 
478 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  52.5 
 
 
474 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  51.65 
 
 
476 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  54.82 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  53.11 
 
 
472 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  55.58 
 
 
478 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  53.14 
 
 
484 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  54.06 
 
 
459 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  52.7 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  51.63 
 
 
494 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  51.04 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  50.75 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  52.25 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  53.94 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  52.01 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  49.6 
 
 
494 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  50.94 
 
 
458 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  51.36 
 
 
482 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  50 
 
 
462 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  52.84 
 
 
474 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  51.89 
 
 
466 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  52.62 
 
 
466 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  49.18 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  51.61 
 
 
457 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  47.85 
 
 
444 aa  415  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  49.9 
 
 
455 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  48.01 
 
 
453 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  51.6 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  43.31 
 
 
451 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  52.8 
 
 
463 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  51.15 
 
 
468 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  50.1 
 
 
517 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  48.32 
 
 
489 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  45.59 
 
 
452 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  50 
 
 
458 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  42.37 
 
 
446 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  49.79 
 
 
472 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  49.59 
 
 
453 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  43.9 
 
 
449 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  41.36 
 
 
474 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  48.63 
 
 
448 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  39.29 
 
 
471 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  45.15 
 
 
448 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  41.25 
 
 
446 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  40.97 
 
 
447 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  46.14 
 
 
470 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  41.25 
 
 
446 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  42.09 
 
 
438 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  42.98 
 
 
444 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  46.75 
 
 
440 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  46.81 
 
 
436 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  46.98 
 
 
455 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  43.51 
 
 
452 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  46.7 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  44.68 
 
 
439 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  44.87 
 
 
463 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  39.71 
 
 
452 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  44.51 
 
 
456 aa  359  8e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  41.19 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  43.28 
 
 
463 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  41.95 
 
 
457 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  40.98 
 
 
443 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  45.76 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  43.07 
 
 
456 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  41.56 
 
 
443 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  47.01 
 
 
437 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  40.76 
 
 
443 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  41.89 
 
 
457 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  42.44 
 
 
452 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  46.24 
 
 
460 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  41.47 
 
 
457 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  40.17 
 
 
446 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  42.58 
 
 
450 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  40.04 
 
 
447 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  40.79 
 
 
468 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  40.17 
 
 
453 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  42.34 
 
 
465 aa  340  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  40.82 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  40.47 
 
 
451 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  40.26 
 
 
451 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  40.26 
 
 
451 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  40.69 
 
 
451 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  41.97 
 
 
467 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  38.28 
 
 
454 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  46.38 
 
 
444 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  42.98 
 
 
445 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  41.46 
 
 
499 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  36.08 
 
 
467 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  39.33 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  39.83 
 
 
461 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  41.53 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>