More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3397 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  100 
 
 		 482 aa  972    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  51.47 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  45.92 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  49.54 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  42.64 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  49.09 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  44.86 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  48.41 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  42.15 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  46.91 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  45.29 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  44.47 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  45.01 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  46.88 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  50 
 
 		 444 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  45.22 
 
 		 478 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  43.8 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  45.01 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  44.73 
 
 		 484 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  46.4 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  42.71 
 
 		 487 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  45.02 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  44.72 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  44.07 
 
 		 448 aa  349  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  44.9 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  46.51 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  46.74 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  43.53 
 
 		 463 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  39.13 
 
 		 446 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  43.61 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  38.86 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  44.12 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  44.69 
 
 		 458 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.4 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.89 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  45.39 
 
 		 463 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  43.71 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  43.38 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  44.23 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  44.63 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  42.92 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  45.9 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  42.73 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  40.82 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  46.55 
 
 		 453 aa  332  9e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  42.03 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  43.12 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  41.46 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  45.84 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  44.18 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  42.11 
 
 		 458 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  43.43 
 
 		 448 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  38.74 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  40.18 
 
 		 458 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  42.16 
 
 		 455 aa  328  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  41.61 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  43.3 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  43.44 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  42.45 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  42.89 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  42.27 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  39.37 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  42.95 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  39.64 
 
 		 438 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  44.57 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  42.48 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  40.09 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  45.49 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  43.36 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  42.54 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  40.8 
 
 		 468 aa  323  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  43.9 
 
 		 486 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  44.96 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  42.34 
 
 		 479 aa  320  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  44.59 
 
 		 455 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  39.05 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  41.81 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  41.97 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  42.55 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  41.59 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  40.49 
 
 		 457 aa  316  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2987  glycoside hydrolase family protein  42.09 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  43.06 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  39.55 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  40.55 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  38.91 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2850  glycoside hydrolase family protein  42.79 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  40.77 
 
 		 444 aa  309  9e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  41.04 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  38.39 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  40.73 
 
 		 517 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  40.53 
 
 		 488 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  42.02 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  37.89 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  39.26 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  41.18 
 
 		 456 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  37.73 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  37.89 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>