More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1586 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  65.61 
 
 
475 aa  689    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  100 
 
 
479 aa  998    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  57.67 
 
 
459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  57.45 
 
 
459 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  50.22 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  47.39 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  49.14 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  48.47 
 
 
461 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  48.59 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  49.56 
 
 
457 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  50.22 
 
 
465 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  50.43 
 
 
464 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  49.15 
 
 
470 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  47.71 
 
 
461 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  45.79 
 
 
460 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  46.49 
 
 
460 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  46.49 
 
 
460 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  46.27 
 
 
460 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  47.59 
 
 
462 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  46.49 
 
 
460 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  46.27 
 
 
460 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  43.6 
 
 
470 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  40.6 
 
 
478 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  41.19 
 
 
478 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  40.26 
 
 
478 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  41.65 
 
 
475 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  39.65 
 
 
452 aa  343  4e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  38 
 
 
465 aa  320  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  35.64 
 
 
451 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  32.69 
 
 
467 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  35.42 
 
 
476 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  35.68 
 
 
468 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  34.35 
 
 
463 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.77 
 
 
453 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  33.19 
 
 
471 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.11 
 
 
450 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  33.82 
 
 
465 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  32.9 
 
 
446 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  31.81 
 
 
474 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  33.89 
 
 
469 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  32.98 
 
 
478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  32.63 
 
 
439 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  31.3 
 
 
467 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  33.69 
 
 
446 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  33.54 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  33.48 
 
 
446 aa  240  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.95 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  31.37 
 
 
472 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  31.02 
 
 
478 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  32.32 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  32.84 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  32.14 
 
 
474 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  32.78 
 
 
470 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  31.61 
 
 
452 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  31.05 
 
 
458 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  31.17 
 
 
448 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  30.99 
 
 
475 aa  229  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  30.88 
 
 
484 aa  227  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.32 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  32.16 
 
 
909 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  29.56 
 
 
452 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  30.93 
 
 
467 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.43 
 
 
448 aa  226  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 
478 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  30.35 
 
 
444 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  31.6 
 
 
470 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  31.6 
 
 
470 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.41 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  30.41 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  29 
 
 
489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  29.11 
 
 
487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  29.3 
 
 
488 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  32.61 
 
 
482 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.25 
 
 
478 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  30.04 
 
 
478 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  30.18 
 
 
451 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  29.16 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  30.63 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  31.09 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  31.45 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  30.18 
 
 
451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  30.62 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  30.75 
 
 
443 aa  213  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  29.54 
 
 
455 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  29.74 
 
 
451 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  30.22 
 
 
443 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  30.15 
 
 
468 aa  211  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  30.5 
 
 
447 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.91 
 
 
449 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  29.31 
 
 
448 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  28.91 
 
 
467 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.96 
 
 
477 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.96 
 
 
477 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.96 
 
 
477 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.96 
 
 
477 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 
473 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  29.98 
 
 
478 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  30.77 
 
 
474 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.82 
 
 
457 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.8 
 
 
479 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>