More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6477 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  100 
 
 		 450 aa  912    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  60.79 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  60.09 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  58.9 
 
 		 458 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  48.16 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  43.58 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  43.45 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  42.92 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  42.47 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  42.96 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  44.29 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  45.74 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  45.92 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  42.99 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  47.37 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  48.76 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  44.7 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  46.05 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  43.88 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  44.29 
 
 		 458 aa  362  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  42.17 
 
 		 446 aa  362  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  46.86 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  47.7 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  45.7 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  45.41 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  43.56 
 
 		 476 aa  358  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  46.36 
 
 		 488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  46.8 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  44.16 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.36 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  47.78 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  45.71 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  45.95 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  45.02 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  47.94 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  44.67 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  47.83 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  44.95 
 
 		 450 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  41.67 
 
 		 439 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  47.58 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  43.22 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  43.95 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  42.89 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  45.91 
 
 		 500 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  44.96 
 
 		 467 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  44.06 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  44.52 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  46.47 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  44.32 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  44.93 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  47.22 
 
 		 463 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  45.97 
 
 		 489 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  44.29 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  46.1 
 
 		 453 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  44.62 
 
 		 482 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  42.42 
 
 		 487 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  44.07 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  44.63 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  44.12 
 
 		 462 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  41.38 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  46.15 
 
 		 455 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  38.24 
 
 		 452 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  42.46 
 
 		 482 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  41.71 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  44.52 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  46.31 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  43.89 
 
 		 470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  43.21 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  43.41 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  40.53 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  43.22 
 
 		 448 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  41.61 
 
 		 451 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  40.9 
 
 		 457 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  40.78 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  40.55 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  46.54 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  41.24 
 
 		 443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  41.61 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  43.29 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  41.38 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  41.36 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  44.88 
 
 		 472 aa  333  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  46.48 
 
 		 471 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  42.95 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  43.61 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  41.15 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  40.39 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  43.4 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  42.24 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  42.4 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  42.63 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  38.57 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  41.82 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  39.95 
 
 		 447 aa  326  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  39.54 
 
 		 450 aa  326  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  40.63 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  41.25 
 
 		 479 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  44.04 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  38.55 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  42.38 
 
 		 463 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>